Yapı İşleri ve Teknik Daire Başkanlığı, 15 Nisan 2015 tarihli Resmî Gazetede yayımlanarak yürürlüğe giren 27.03.2015 tarih ve 6639 sayılı Kanun gereğince sağlık temalı olarak kurulan ilk ve tek devlet üniversitesi olma özelliğine sahip olan üniversitemizin idari birimlerinden biridir. Başkanlığımız, çalışmalarını Genel Sekreterlik Makamına bağlı olarak yürütmektedir. Mekteb-i Tıbbiyye-i Şahane Külliyesi ve Gülhane Külliyesinde olmak üzere iki ayrı yerleşkede yer alan ekipler halinde faaliyetlerini sürdürmektedir. 

MİSYON
Mevcut yasa ve yönetmelikler çerçevesinde; Üniversitemizdeki eğitim ve yaşam kalitesini artırmak için ihtiyaç duyulan fiziki mekanların yapım, bakım ve onarım hizmetlerini Üniversitemiz kaynaklarını en verimli şekilde kullanarak gerekli her türlü hizmet ve desteği sağlamak.

VİZYON
Üniversitemizin hedefleri, ilkeleri ve stratejik planları doğrultusunda, tüm birimlerin ihtiyacı olan yapılaşmayı, altyapıyı, teknolojiyi, donanımı ve teknik desteği sağlayabilmek için gerekli fiziki altyapıyı üniversitemizin hizmetine hazır halde tutmaktır.

TEMEL DEĞERLER
•    Türkiye Cumhuriyeti’nin milli ve manevi temel ilke ve değerlerine sadakatle bağlılık,
•    İhtiyaçları tespit ederek zamanında karşılamak
•    Eğitimin önceliğini dikkate almak ve eğitimi aksatacak iş ve işlemde bulunmamak
•    Takım çalışması
•    Hizmette süreklilik ve şeffaflık anlayışı
•    Kalite bilinci
•    Bilimsel ve etik kurallara uyum